五药企借联邦学习用私有数据提升 AI 药物研发模型精度
2 小时前

以AlphaFold 3为代表的共折叠模型,在真实药物研发场景中精度尚未达到实用标准,主要因为公开的蛋白-药物分子配对数据稀缺,而药企的私有数据又难以在保密的前提下被有效利用。艾伯维等五家药企利用Apheris的联邦学习架构,基于OpenFold3 Preview 2模型,结合超过2万条私有蛋白-配体结构数据,训练出了AISB-1-Fed模型。该模型在关键指标上优于公开模型及单一药企微调的模型,尤其在蛋白-蛋白界面预测方面表现突出。经测试,该模型未泄露任何数据,性能提升主要得益于私有数据的应用。当前,多数共折叠模型基于PDB数据训练,存在“死记硬背”、泛化性差的问题。为此,行业正在探索数据解决方案:除AISB采用的联邦学习路线外,礼来推出了TuneLab平台,还有OpenBind、LIGAND-AI等新造公开数据的项目。业内认为,联邦学习只是权宜之计,新造数据更具长期价值。此外,联邦学习仅能部分赋能药物研发,共折叠模型的下一阶段发展需从静态结构预测转向动力学建模,存量私有数据与新造数据均不可或缺。