二十多年前,人类基因组计划顺利完成,但理解DNA碱基功能及其突变后果仍是难题。为此,Google DeepMind推出了AlphaGenome Atlas,该工具基于AlphaGenome模型,预计算了人类参考基因组中超过90亿种单碱基变化对基因表达等方面的影响,并形成了约1PB的数据集,免费供科研人员非商业使用。此外,该数据集还引入了AVI变异影响分数,整合了多层面信息,有助于筛选和排序变异,同时提供特征归因及2500多种DNA基序信息。目前,研究人员已将其应用于罕见病和人群遗传学研究,能够从大量候选变异中筛选出更具研究价值的对象。有科研人员评价,这一工具能简化分析流程、降低算力门槛,但也存在无法覆盖远距离调控关系等局限,且AVI分数并不等同于致病性,其结果需结合其他证据进行验证,目前仅适用于科研,不适用于临床诊断。
